1929 yılında Kütahya’da doğdu. İlk, orta ve lise öğrenimini bu şehirde tamamladı. İstanbul Hukuk Fakültesini bitirdi.

Yedek subaylık ve sonrasında Cumhuriyet Savcılığı döneminde Anadolu'nun değişik yerlerinde görev yaptı.

Kütahya Azot İşletmeleri Hukuk Müşavirliği, Akdeniz Gübre A.Ş. Yönetim Kurulu Başkanlığının yanı sıra uzun yıllar serbest avukatlık yaptı.

Kütahya İl Genel Meclisi ve Belediye Meclisi Üyeliklerinde de bulunan Mustafa Peçen, iki dönem de Kütahya Barosu Başkanlığı görevini üstlendi.

Evli ve biri kız, üç çocuk babasıdır.